6、清洗完毕后，在淡水排放阀打开状态下运行反渗透系统，直至淡水清洁、无泡沫或无清洗液，通常需要15-30min的时间。
反渗透膜清洗的注意事项：
酸洗过程中，应随时检查清洗液的pH值变化，溶解无机盐类沉淀消耗酸时，pH的增加超过0.5个pH值单位，应向清洗箱补充酸，酸性清洗液的总循环时间不得超过20分钟，超过此时，清洗液可能被清洗的无机盐饱和，污染物再次沉积在膜表面系统必须停止24小时以上时，请将零件保存在1%(重量比)的亚硫酸氢钠水溶液中。在清洗大型系统之前，建议从需要清洗的系统中取出膜部件，进行部件清洗效果试验评价。
低流量输入清洗液
首先用清洗水泵混合一遍清洗液，预热清洗液时应以低流量（表7-1所列值的一半）。
然后以尽可能低的清洗液压力置换元件内的原水，其压力仅需达到足以补充进水至浓水的压力损失即可，即压力必须低到不会产生明显的渗透产水。低压置换操作能够最大限度的减低污垢再次沉淀到膜表面，视情况而定，排放部分浓水以防止清洗液的稀释。
表7-1.高流量循环期间每支压力容器建议流量和压力
循环
当原水被置换掉后，浓水管路中就应该出现清洗液，让清洗液循环回清洗水箱并保证清洗液温度恒定。
浸泡
停止清洗泵的运行，让膜元件完全浸泡在清洗液中。有时元件浸泡大约1小时就足够了，但对于顽固的污染物，需要延长浸泡时间，如浸泡10~15小时或浸泡过夜。为了维持浸泡过程的温度，可采用很低的循环流量（约为表7-1所示流量的10%）。
高流量水泵循环
按表7-1所列的流量循环30~60分钟。高流量能冲洗掉被清洗液清洗下来的污染物。如果污染严重，请采用高于表7-1所规定的50%的流量将有助于清洗，在高流量条件下，将会出现过高压降的问题，单元件最大允许的压降为1bar（15psi），对多元件压力容器最大允许压降为3.5bar（50psi），以先超出为限。
冲洗
预处理的合格产水可以用于冲洗系统内的清洗液，除非存在腐蚀问题（例如，静止的海水将腐蚀不锈钢管道）。为了防止沉淀，最低冲洗温度为20℃。
